Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Nf1Q04690 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms