Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnb1Q03717 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms