Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pax5Q02650 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pax5Q02650 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms