Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd1Q01822 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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