Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Pde1bQ01065 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Pde1bQ01065 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Pde1bQ01065 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Pde1bQ01065 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde1bQ01065 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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