Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PrcdQ00LT2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms