Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SeleQ00690 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SeleQ00690 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SeleQ00690 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms