Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms