Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cited1P97769 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Cited1P97769 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cited1P97769 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cited1P97769 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cited1P97769 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cited1P97769 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cited1P97769 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cited1P97769 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cited1P97769 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cited1P97769 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cited1P97769 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cited1P97769 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cited1P97769 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cited1P97769 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cited1P97769 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cited1P97769 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cited1P97769 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cited1P97769 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cited1P97769 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cited1P97769 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cited1P97769 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms