Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkp1P97350 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms