Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx1P83917 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cbx1P83917 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms