Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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