Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux2P70298 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cux2P70298 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux2P70298 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux2P70298 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux2P70298 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux2P70298 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux2P70298 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux2P70298 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux2P70298 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux2P70298 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux2P70298 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux2P70298 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms