Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp7P70280 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vamp7P70280 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vamp7P70280 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vamp7P70280 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp7P70280 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp7P70280 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp7P70280 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp7P70280 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp7P70280 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp7P70280 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp7P70280 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp7P70280 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp7P70280 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp7P70280 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp7P70280 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp7P70280 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp7P70280 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vamp7P70280 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vamp7P70280 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp7P70280 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp7P70280 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp7P70280 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp7P70280 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp7P70280 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp7P70280 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp7P70280 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp7P70280 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vamp7P70280 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vamp7P70280 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp7P70280 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp7P70280 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp7P70280 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vamp7P70280 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms