Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbdsP70122 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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