Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
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