Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpfP62307 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpfP62307 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms