Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ube2kP61087 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2kP61087 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2kP61087 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2kP61087 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2kP61087 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2kP61087 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2kP61087 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2kP61087 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2kP61087 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2kP61087 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2kP61087 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2kP61087 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2kP61087 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2kP61087 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2kP61087 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2kP61087 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2kP61087 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2kP61087 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2kP61087 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2kP61087 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2kP61087 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms