Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Polr2iP60898 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Polr2iP60898 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Polr2iP60898 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Polr2iP60898 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Polr2iP60898 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Polr2iP60898 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Polr2iP60898 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Polr2iP60898 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Polr2iP60898 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Polr2iP60898 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Polr2iP60898 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Polr2iP60898 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2iP60898 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms