Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snap25P60879 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms