Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scarf2P59222 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms