Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Paxbp1P58501 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms