Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms