Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gsc2P56916 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms