Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NrlP54846 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NrlP54846 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NrlP54846 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NrlP54846 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NrlP54846 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NrlP54846 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NrlP54846 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NrlP54846 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NrlP54846 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NrlP54846 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NrlP54846 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NrlP54846 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NrlP54846 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NrlP54846 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NrlP54846 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NrlP54846 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NrlP54846 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NrlP54846 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NrlP54846 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NrlP54846 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NrlP54846 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NrlP54846 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms