Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TspoP50637 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TspoP50637 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TspoP50637 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TspoP50637 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TspoP50637 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TspoP50637 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms