Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FmodP50608 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FmodP50608 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms