Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnni3P48787 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms