Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VdrP48281 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VdrP48281 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms