Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Sdc2P43407 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Sdc2P43407 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdc2P43407 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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