Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms