Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cap1P40124 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms