Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf1P39428 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf1P39428 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf1P39428 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf1P39428 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf1P39428 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf1P39428 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf1P39428 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf1P39428 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf1P39428 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms