Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TtlP38585 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TtlP38585 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms