Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ly6dP35459 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ly6dP35459 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms