Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TpoP35419 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TpoP35419 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TpoP35419 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TpoP35419 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TpoP35419 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TpoP35419 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TpoP35419 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TpoP35419 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TpoP35419 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TpoP35419 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TpoP35419 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TpoP35419 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TpoP35419 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TpoP35419 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TpoP35419 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TpoP35419 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TpoP35419 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TpoP35419 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TpoP35419 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TpoP35419 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TpoP35419 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TpoP35419 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TpoP35419 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TpoP35419 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TpoP35419 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TpoP35419 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TpoP35419 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TpoP35419 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TpoP35419 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TpoP35419 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TpoP35419 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TpoP35419 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TpoP35419 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TpoP35419 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TpoP35419 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms