Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn11P35235 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms