Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp4P35123 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms