Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc5P32043 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms