Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctnnd1P30999 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms