Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp3P28862 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp3P28862 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp3P28862 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp3P28862 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp3P28862 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp3P28862 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp3P28862 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp3P28862 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms