Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BgnP28653 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BgnP28653 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
BgnP28653 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BgnP28653 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BgnP28653 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BgnP28653 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BgnP28653 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BgnP28653 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BgnP28653 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BgnP28653 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
BgnP28653 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BgnP28653 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
BgnP28653 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BgnP28653 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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