Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Slc6a9P28571 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms