Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Pde6aP27664 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Pde6aP27664 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6aP27664 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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