Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afxP27661 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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