Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms