Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
U2af2P26369 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
U2af2P26369 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
U2af2P26369 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
U2af2P26369 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U2af2P26369 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms