Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChgaP26339 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChgaP26339 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ChgaP26339 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChgaP26339 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChgaP26339 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms