Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb9P20615 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb9P20615 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms