Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms